Gracias a que los investigadores del Laboratorio de Genética, Fisiología y Reproducción de la Universidad Nacional del Santa (UNS) desarrollaron una prueba que determina el sexo del paiche en cualquier etapa de su ciclo de vida, los piscicultores podrán mejorar sus procesos y establecer la selección de potenciales parejas reproductoras desde edad temprana.
Este interesante estudio se realizó como parte de la ejecución del proyecto “Aplicación de herramientas ómicas y de edición génica en la producción e investigación de organismos acuáticos de importancia comercial en el Perú”, financiado por el Fondo Nacional de Desarrollo Científico y Tecnológico (FONDECYT) y el Banco Mundial.
La responsable del Laboratorio de Genética, Fisiología y Reproducción de la UNS, M. Sc. Eliana Zelada Mázmela, detalló que, tras el ensamble genómico De novo, de hembra y de macho por separado, de secuencias illumina NGS (250 pb), provenientes de hembras (n=2) y machos (n=2) de A. gigas (Du et al., 2019), alojadas en la base de datos SRA del NCBI, se procedió a realizar la búsqueda de genes candidatos sexo-específicos. Para ello, se desarrolló una metodología bioinformática novedosa en el Laboratorio de Genética, Fisiología y Reproducción, que consiste en el uso de múltiples programas que se utilizan actualmente para el mapeo y filtrado de secuencias de NGS, pero que no han sido utilizados para la obtención de secuencias sexo-específicas.
“Estos resultados, que nos alegran sobremanera como grupo de investigación de la Universidad Nacional del Santa, han sido submitidos como artículo en una revista del área para su revisión por pares. Los cultivadores de paiche en nuestro país pronto tendrán una herramienta que les permita establecer sus parejas reproductoras desde edad temprana”, finalizó Zelada Mázmela.
El artículo completo puede ser revisado en el repositorio de bioRxiv, a través del siguiente enlace: Non-invasive sex genotyping of paiche Arapaima gigas by qPCR: An applied bioinformatic approach to identify sex differences
Fuente: Universidad Nacional del Santa
Es decir, la nueva herramienta genómica, denominada técnicamente “marcador molecular”, permitirá que los cultivadores de paiche puedan identificar el sexo de dicha especie a edad temprana, con lo que optimizarán tiempo y dinero; además de disminuir el riesgo de realizar una mala selección de los futuros reproductores.
Este interesante estudio se realizó como parte de la ejecución del proyecto “Aplicación de herramientas ómicas y de edición génica en la producción e investigación de organismos acuáticos de importancia comercial en el Perú”, financiado por el Fondo Nacional de Desarrollo Científico y Tecnológico (FONDECYT) y el Banco Mundial.
La responsable del Laboratorio de Genética, Fisiología y Reproducción de la UNS, M. Sc. Eliana Zelada Mázmela, detalló que, tras el ensamble genómico De novo, de hembra y de macho por separado, de secuencias illumina NGS (250 pb), provenientes de hembras (n=2) y machos (n=2) de A. gigas (Du et al., 2019), alojadas en la base de datos SRA del NCBI, se procedió a realizar la búsqueda de genes candidatos sexo-específicos. Para ello, se desarrolló una metodología bioinformática novedosa en el Laboratorio de Genética, Fisiología y Reproducción, que consiste en el uso de múltiples programas que se utilizan actualmente para el mapeo y filtrado de secuencias de NGS, pero que no han sido utilizados para la obtención de secuencias sexo-específicas.
“Los dos genomas ensamblados se alinearon bioinformáticamente en la búsqueda de regiones diferentes, diseñándose primers para las secuencias específicas del macho. Los primers diseñados fueron probados en ADN de machos y hembras de A. gigas, proveniente de gónadas, aleta y mucus branquial, a través de PCR convencional y qPCR, con 100 % de efectividad”, añadió la docente.
“Estos resultados, que nos alegran sobremanera como grupo de investigación de la Universidad Nacional del Santa, han sido submitidos como artículo en una revista del área para su revisión por pares. Los cultivadores de paiche en nuestro país pronto tendrán una herramienta que les permita establecer sus parejas reproductoras desde edad temprana”, finalizó Zelada Mázmela.
El artículo completo puede ser revisado en el repositorio de bioRxiv, a través del siguiente enlace: Non-invasive sex genotyping of paiche Arapaima gigas by qPCR: An applied bioinformatic approach to identify sex differences
Fuente: Universidad Nacional del Santa